ГлавУпДК при МИД России является коммерческой организацией, находящейся в ведомственном подчинении Министерства иностранных дел Российской Федерации (МИД России). Полномочия собственника имущества Предприятия осуществляют Федеральное агентство по управлению государственным имуществом (Росимущество) и Министерство иностранных дел Российской Федерации